十二指肠球炎患者可遵医嘱应用抑制胃酸分泌药物、保护胃黏膜药物、促进胃肠蠕动的药物等，可同时起到保护胃黏膜的作用。
1、抑制胃酸分泌药物：如奥美拉唑肠溶胶囊、兰索拉唑片等，对各种原因引起的胃酸分泌具有强而持久的抑制作用，对于治疗十二指肠球炎有良好的效果，同时还能保护胃黏膜；
2、保护胃肠黏膜药物：如铝碳酸镁颗粒、胶体果胶铋胶囊等，可对胃部形成保护；
3、促进胃肠动力药物：如多潘立酮片、枸橼酸莫沙必利片等，能够增加食道下部括约肌的张力，可以防止胃和食道反流，抑制恶心、呕吐，还能增加肠胃蠕动、促进胃排空。
此外，十二指肠球炎患者如果是由幽门螺杆菌感染而引起，应当结合抗生素类药物治疗，比如阿莫西林胶囊，能够抑制幽门螺杆菌的繁殖，同时将幽门螺杆菌杀灭，对于十二指肠球部炎症恢复有比较好的效果。
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